范振鑫 简历

副教授，博士生导师

Email: zxfan.AT.scu.edu.cn (请将.AT.替换为@)

教育背景：

2011.02 - 2014.01：美国加州大学洛杉矶分校，Robert Wayne教授实验室，博士联合培养

2007.09 - 2014.07：kaiyun开云官方网站，kaiyun开云官方网站，获理学博士学位

工作经历：

2017.09 – 至今：kaiyun开云官方网站，kaiyun开云官方网站，副教授

2014.07 – 2017.09：kaiyun开云官方网站，kaiyun开云官方网站，特聘副研究员

主要研究方向：

• 生物信息学：以西南地区的野生动物为研究对象，整合多组学数据（基因组、转录组、宏基因组等），结合功能实验，开展适应性进化、濒危机制等研究

• 生物医学：以实验猕猴为研究对象，开展腹泻机制、衰老机制的研究；与医公司合作，从事精准医疗、分子流行病学等基础研究

招生方向：

硕士和博士研究生：生物信息学、动物学、数学、计算机科学

本科生：不限制专业

主要科研项目：

• 国家自然科学基金委员会，面上项目，32370450，基于多组学技术研究肠道微生物在猕猴（Macaca mulatta）衰老过程中的作用机制，2024年1月至2027年12月，主持

• 国家自然科学基金委员会，面上项目，32070413，猕猴 (Macaca mulatta) 衰老过程中凝血功能变化规律及基因表达调控机制研究，2021年1月至2024年12月，主持

• 国家自然科学基金委员会，青年科学基金项目，31501871，基于血液转录组的藏酋猴免疫和糖代谢相关基因的表达研究，2016年1月至2018年12月，主持

• 四川省自然科学基金，杰出青年科学基金项目，2023NSFSC1935，基于宏基因组学和培养组学的实验猕猴腹泻机制研究和新型微生态制剂的开发，2023年1月至2025年12月，主持

• 四川省自然科学基金，重点研发计划，2023YFS0034，儿童肥胖代谢性疾病精准防治研究，2023年1月至2024年12月，参与

• 四川省科技计划，应用基础研究项目，2020YJ0303，猕猴衰老过程基因表达变化及衰老模型初步研究，2020年1月至2021年12月，主持

学术兼职：

• 中国动物学会灵长类学分会理事会第一届（2017-2021）和第二届理事（2022-2026）

• 中国动物学会生物进化理论专业委员会第四届委员会委员（2022-2026）

• 四川省动物学会理事（2022-2027）

获得荣誉：

• 2015年度kaiyun开云官方网站青年科技人才奖

• 2016年度全国优秀青年生态学工作者

• 2018年入选第十二批四川省学术和技术带头人后备人选

   

代表性论文（#并列一作，*通讯作者）：

1. Yang S#, Fan Z#, Li J, Wang X, Lan Y, Yue B, He M, Zhang A*, Li J*. Assembly of novel microbial genomes from gut metagenomes of rhesus macaque (Macaca mulatta). Gut Microbes. 2023 Jan-Dec;15(1):2188848.

2. Liu X, Liu X, Wang X, Shang K, Li J, Lan Y, Wang J, Li J, Yue B, He M*, Fan Z*. Multi-omics analysis reveals changes in tryptophan and cholesterol metabolism before and after sexual maturation in captive macaques. BMC Genomics. 2023 Jun 7;24(1):308.

3. Yang S#, Liu Y#, Yang N#, Lan Y, Lan W, Feng J, Yue B, He M, Zhang L, Zhang A, Price M, Li J*, Fan Z*. The gut microbiome and antibiotic resistome of chronic diarrhea rhesus macaques (Macaca mulatta) and its similarity to the human gut microbiome. Microbiome. 2022 Feb 9;10(1):29. doi: 10.1186/s40168-021-01218-3.

4. Du L, Liu Q, Zhao K, Tang J, Zhang X, Yue B*, Fan Z*. PSMD: An extensive database for pan-species microsatellite investigation and marker development. Molecular Ecology Resources 2020 Jan;20(1):283-291.

5. Zhou M#, Zhang L#, Yang Q#, Yan C, Jiang P, Lan Y, Wang J, Tang R, He M, Lei G, Sun P, Su N, Price M, Li J, Lin F, Yue B*, Fan Z*. Age-related gene expression and DNA methylation changes in rhesus macaque. Genomics. 2020 Sep 11:S0888-7543(20)31116-2. doi: 10.1016/j.ygeno.2020.09.021.

6. Du L#, Guo T#, Liu Q, Li J, Zhang X, Xing J, Yue B, Li J*, Fan Z*. MACSNVdb: a high-quality SNV database for interspecies genetic divergence investigation among macaques. Database (Oxford). 2020 Jan 1;2020. pii: baaa027.

7. Lan Y#, Wang J#, Yang Q, Tang RX, Zhou M, Lei GL, Li J, Zhang L, Yue BS, Fan ZX*. Blood transcriptome analysis reveals gene expression features of breast-feeding rhesus macaque (Macaca mulatta) infants. Zoological Research 2020 Jul 18;41(4):431-436.

8. Yan CC#, Zhang XS#, Zhou L, Yang Q, Zhou M, Zhang LW, Xing JC, Yan ZF, Price M, Li J, Yue BS, Fan ZX*. Effects of aging on gene expression in blood of captive Tibetan macaques (Macaca thibetana) and comparisons with expression in humans. Zoological Research 2020 Sep 18;41(5):557-563.

9. Fan Z#, Li W#, Jin J, Cui K, Yan C, Peng C, Jian Z, Bu P, Price M, Zhang X, Shen Y, Li J, Qi W*, Yue B*. 2018. The draft genome sequence of forest musk deer (Moschus berezovskii). Gigascience 7(4). doi: 10.1093/gigascience/giy038.

10. Fan Z, Zhou A, Osada N, Yu J, Jiang J, Li P, Du L, Niu L, Deng J, Xu H, Xing J, Yue B, Li J. 2018. Ancient hybridization and admixture in macaques (genus Macaca) inferred from whole genome sequences. Mol Phylogenet Evol. 127:376-386.

11. Fan Z, Silva P, Gronau I, Wang S, Armero AS, Schweizer RM, Ramirez O, Pollinger J, Galaverni M, Ortega Del-Vecchyo D, Du L, Zhang W, Zhang Z, Xing J, Vilà C, Marques-Bonet T, Godinho R, Yue B, Wayne RK. 2016. Worldwide patterns of genomic variation and admixture in gray wolves. Genome Research, 26(2): 163-173.

12. Fan Z, Zhao G, Li P, Osada N, Xing J, Yi Y, Du L, Silva P, Wang H, Sakate R, Zhang X, Xu H, Yue B, Li J. 2014. Whole genome sequencing of Tibetan macaque (Macaca thibetana) provides new insight into the macaque evolutionary history. Molecular Biology and Evolution, 31(6), 1475-1489.